El MUA se especializa exclusivamente en el arte contemporáneo y lleva a cabo actividades de investigación en esta área, así como la producción, conservación, documentación, difusión y enseñanza de este arte.
El Museo basa su actividad en la difusión de patrimonio histórico-artístico, la presentación de resultados de investigación obtenidos en el campus de la Universidad de Alicante y la difusión de obras artísticas del siglo XXI, con especial énfasis en las formas más modernistas de expresión.